Jun Seita, MD, PhD
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Deep Learning x Medical Sciences and Beyond @ RIKEN ADSP/IMS/R-IH/AIP/CPR/R-CCS, NIG, University of Tsukuba, and avatarin. ex-Stanford. Personal account.
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弊研究室ではポスドクポジションの公募を行っています。医学領域の予測問題、自律的科学発見、創造性の獲得に対する深層学習または量子コンピューティングの応用のいずれかのテーマにおいて独創的な研究提案をお待ちしております。
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誰だ「5G」って言ったの。
＃自民党 の ＃菅義偉 総裁（中央）と記念写真に納まる新四役の（左から）山口泰明選対委員長、佐藤勉総務会長、二階俊博幹事長、下村博文政調会長です。東京・永田町の自民党本部 （裕）
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出張旅費の精算が円建て日当方式（しかも世界中に東横インがあると想定しているとしか思えない金額設定）の現状だと、円安＆物価上昇を全く吸収できなくて、学生さんに「採択おめでとう。良い機会だから国際学会で発表してきなさい。」とは言えない状況だなぁ・・・
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最近研究の現場の上層部に「KPI」とかいう概念が侵入してきて年度の初めに今年度の計画書書け〜、年度末の評価指標（定量的なやつ）だせーって言ってくる横で「革新的な」「斬新な」「創発」「共創」とか言ってるのホント矛盾してる。1年前に計画できてて順調に進むところにイノベーションなんか無い。
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これがかの邪悪な全例陰性に出る検査キットか！さすが楽天。導入企業様担当者におかれては安心しかない。「新型コロナの特徴的な塩基配列を持つDNAが含まれているかどうかを判定する。」注）コロナウイルスはRNAウイルス。
楽天、PCR検査キット販売開始 法人向け、関東の5都県
もはや害悪でしかない。規制当局や医師会におかれては、医療まがい行為として吊し上げて欲しい。
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COVID-19なんで、怖い話しますね...
感染症も疫学も専門じゃない科学者「あっ、いいことおもいついた！」
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AlphaFoldすげーってなったバイオ関係者はもれなくこのドキュメンタリー見た方がいいよ。弊ラボでは必修です。
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AF2はバイオ界が直面するAIによるdisruptの最初の例だと思うんだけど、DeepMind社設立から11年、AFプロジェクトは5年くらい？的確な目標を設定してものすごい人件費を投入して集中し続けた結果。役所は気軽に「破壊的XXの創出」って言わないでね。
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ほら、こうやって科学的にまだ証明されていないことが期待先行で既成事実化されて行く。NHKの罪は重いよ。 cc
@haru_negami
待って待って待って待って待ッッッッッて
これ、私もまた喋れるようになる？？
あの人も、動かない足に泣かなくてすむ？？？
すごい驚いて今ごっほごっほむせてる
Ｎスペで話題沸騰 「ペニシリン以来の大発見」脊髄損傷を直す新治療が保険適用へ｜ニフティニュース
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医療分野AIのトップカンファレンスに来てるんですけど、もう採択された論文の半分以上がLLMを使いこなすの当たり前の研究。政府のクラウド安全基準満たしてないから契約できないとか言ってる国に未来はない。
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5年前ラボを始めた時にサーバに名前をつける必要があり、日本橋から始まる東海道五十三次の宿場名を使うことにした。53あれば余裕だろうと思ったら、あっという間に滋賀県の水口宿に達してしまい、計算能力はPeta FLOPSに・・・もうすぐ三条大橋に。
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リアル朝日新聞入手。この肌感覚が1面に載ったのは大事。
今朝の朝日新聞1面トップ、松岡聡先生
@ProfMatsuoka
富岳の「飛沫計算」ChatGPT自力で発案 AIに科学を任せる日
2面には清田純先生
@jseita
ほかにも朝日新聞「新生AI」シリーズ にいろいろ
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@ImAI_Eruel
スポーツAIやってますが、常設の専用スタジムにそれ用の機材を組み込まないと精度が出ないので、オリンピックみたいな短期のイベントではペイしない。本番での選手は練習では見られない超絶な動きをするので正解データが作りにくい、などなど、結構大変です。
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その「沢山の偉い人」、太平洋挟んだカリフォルニアの私大の定義だと世帯年収1500万円以下は「貧困」なので学費免除、っていう世界線が存在すること知らないんだろうなぁ・・・
金がないので進学できません！って言った時、金がないこと分かってんならそもそも受験するなって沢山の偉い人から言われたけど、
いやそうじゃなくて受かる実力あるんだから社会が頑張ってそういう若者を進学させろよ、という上から目線スタンスだったので、金ないのにこの大学受けました
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@Hiroshi99857672
@TKAZ15392397
日本人留学生が激減したのではなく、大学側が日本人の採用を控えているのですよ。当時の方々が卒業後元の起業に帰ってサラリーマンを継続したので、MBAが期待した世界を変える人が出る率があまりに低かったので。卒業後の大学への寄付額も。
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研究の本当に面白いアイデアというのは、雑談に限りなく近いディスカッションから出てくるんだよな〜。これはZoomでは難しい。
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「学者の良心」には「一般の方にミスリードが生じないように情報を発信する」が（かなり上位で）含まれているべきだと思うぞ。
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共和党がオバマに嫌がらせするためにgov shutdownしたらH1-Bが期限までに更新できずに突然大学の弁護士に肩叩かれて「3日以内にUSから退去するように」言われた話、する？
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本当だ、Scienceからダウンロードした論文のPDF、検索もテキスト検索もできないように細工してある。セコい。
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みんな、論文のコストが運営費交付金に反映されるのは、その方式を自ら選んだ16国立大学だけが対象だからね。仕組みを知ってから感想を述べて。
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10月1日付で筑波大学教授（グローバル教育院）を拝命しました。
本務は引き続き理研のままですが、筑波大学の卓越大学院ヒューマニクス学位プログラムに参画して、母校の医療 x AIが盛り上がるように尽力いたします。
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本日付で理化学研究所・情報統合本部・基盤研究開発部門・医科学データ共有開発ユニットのユニットリーダーに「も」着任しました。バイオxAIはIMSで、医学xAIはADSPで、医科学データのオープンサイエンスは当ラボで展開していくことになります。
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日本人のIF脳は18才の価値観（お受験の「偏差値」）をおっさんになるまでずーーーと引きずってる査証なんだよね・・・
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本日付で理化学研究所・生命医科学研究センター・統合ゲノミクス研究チームのチームリーダーに着任しました。同・医科学イノベーションハブ推進プログラム・健康データ深層学習チーム・チームリーダーも引き続き担当いたします。横浜→Single Cell Biology x Deep Learning x Medicine←日本橋
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本来転出転入手続きはマイナンバーカードだけで完結するはずだが、窓口の人に「これからすぐ次の役所に向かわれますか？その場合データの移動が間に合わないので紙での手続きになります。」って言われて無になった。伝書鳩でも使ってるのか？デジタルで何をトランスフォーム？ cc
@konotarogomame
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理研で最初に立ち上げた医療xAIのラボは今月が最終月なのだが、共同研究者に恵まれて3年半でNeurIPS workshop採択2回、Cell, Nature他原著論文6報、深層学習の論文3報、招待講演15回、ファッションショー2回。忙しかったけど、まだまだ精進可能だなぁ。
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医学生物系の論文で統計が誤用されまくった結果「統計学の専門家のサインをつけろ」と要求する雑誌が出てきたように、近いうちに「機械学習/深層学習の専門家のサインをつけろ」になりそうだな。
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これって「ヒトを対象とした研究」だよね？倫理審査いらんの？
【五輪「地ならし」観客上限1万人】
緊急事態宣言やまん延防止等重点措置の解除後、大規模イベントの観客上限を1万人とすることが決まった。東京五輪を有観客で開催する「地ならし」で、政府高官は「何かエビデンス（科学的根拠）があったわけではない」。
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というわけで科学クラスタ・医クラの皆さまは、このまとめYTで予習したのち、今晩10:30に菅研究所集合でお願いします。#ネメシス
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日本の大学は、個人の資本主義勝者に立脚したUSの大学よりも、大企業などと上手く付き合ってるヨーロッパの大学から学んだ方が相性が良い気がするんだよな・・・
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バイオの世界に深層学習業界のスピード感がやってきた。完全に。
After 2 weeks of working together intensively, we proudly present our assessment of using
#alphafold2
from
@DeepMind
for peptide-protein docking: it works!
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しかも解決方法がない。
・「差額は自腹ね」「何ハラですか？」
・「この予算で泊まれるところとまってね」「まわりが麻薬の売人ばっかりでした。何ハラですか？」
・「ここに自由に使える講座費があるので持っていきなさい」「その財源って・・・ブラック？」
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でも彼らは基本的に「五年で結果出さないと」絶対に更新できないNSFグラントやNIH R01を原資にラボ運営をしているはずで、重要なのは毎回塁に出るプロジェクトをやりつつ、何年かかるかわからないプロジェクトも回す運営能力。
やっぱり、本当のブレークスルーは、小さなところにこだわり抜いた結果なのだ。マイクロRNAの二例目は第一報の7年後にラブカンがネイチャー３ページの論文で報告、それが進化的に脊椎動物まで保存していることも示している。その間、諦めずに研究してるわけだ。「五年で結果出せ」ではない。
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Tweets are now considered as scientific publications. Each tweet deserves DOI.
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パレスホテル東京のクラウンでは、先行研究1の通りこのグランドピアノのショコラが繊細でとても美味しかった。
1) Tisin et al.
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@masanork
@h_okumura
Apple Watchなどに搭載されている「反射型」SpO2は極めて精度が悪いのでFDAの認可も結局通せなかったのですよ。なぜ市販されているSpO2計は全て指や耳たぶを「挟む」形なのか、考えてみてから批判してみては？
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というわけで #ネメシス 第9話をヘッドフォンでもう一回観ます。劇中音楽がこれまたすばらしいんですよね。そして拍に完璧にシンクロするカット割が心拍数を上げる！
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Ph.D. Clockという概念があるのでねぇ。（USは博士課程の年数は決まっておらずかかる年数は人それぞれだが、一旦Ph.D.を取るとそのあとは様々なグラントや人事が「Ph.D.取得後n年以内」「Ph.D.取得後m年以降のみ応募可」など年数なりの業績を上げる必要がある）
海外ポスドクに応募するなら、査読論文がアクセプトされた後、博士取得前が一番のチャンスだよ。カナダでもそれは同じ。正式に博士とってから時間が経てば経つほど、チャンスは減ります。＜RT
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@okimatsumoto
@torusengoku
これ「correspondence」なので論文ではなく意見で、査読もされていませんよ。一般の雑誌で言ったら「読者からのお便り」欄くらいの扱い。
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なお研究室でOculus GOを被っていた時、来客があったが
来客「あの人は何をやっているのですか？」
同僚「没入しています。」
来客「研究ですか？」
同僚「研究です。」
と完璧な対応。
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@ImAI_Eruel
そしてオリンピック選手レベルにチューンしたモデルは、マス層の一般プレーヤーには使えないので、商業的にペイしないという問題もあります。AIを使いやすい課題（テニスの線審とか）はあっという間に商業化されていますが。
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日本は検査データは各病院が保持。AMEDが学会に命じてデータを集約中。一方イギリスは国(NHS)が一元管理：DeepMindが使用権を購入。中国はいわずもがな、医師を大量に動員して正解ラベル付けを推進。さてまだ同じ「勝てそうな気」でしょうか？
例えば「AI画像でガン判定！」なシステムを組もうと思っても、「ガン検診の内視鏡画像たくさん溜まってる」状態じゃないとそもそも教師データないんで開発できないわけで、そういう意味で皆保険制度で通院・検査しまくる日本はデータが豊富にあって勝てそうな気がするんだよな。
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この言説に限らず学振とその後のキャリアを大学受験的な発想で結びつける発想を多く見かけるが、はっきり言って全く関係ないだろう。学習ではなく学問を始めて数年目の極めてノイジーな状況下での1つのcompetitionに過ぎない。
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AIトップ学会「NeurIPS」で日本勢6チームが（口頭発表に）採択、1％の狭き門突破し躍進
口頭発表に次ぐスポットライト（採択率3%・日本から11報）で『注目されるのはNEC データサイエンス研究所の伊藤伸志氏である。単著1件も含めて計3件の論文が採択されている。』
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こう感じてしまうのは日本の「偏差値」一つに青春を全投入する「お受験脳」の後遺症なんですよね。プログラムディレクターの職務は厳正な採点をして1つの尺度で上から採用することじゃない。いかにプログラム全体で見たときに成果が上がるポートフォリオを組むか、なんですよね。
米のグラントって不思議。study sectionで議論されてきっちり点数つけられる一方で、まだ一つ目だからちょっと(スコア？)下駄履かせてあげるよとか、すごい惜しかったからもう一度resubmitしていいよとか、謎の温情がある。program directorと電話で話してアドバイスもらうとかもあるし。
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本日付で理化学研究所・医科学イノベーションハブ推進プログラム・健康データ深層学習チームのチームリーダーに着任しました。引き続きよろしくお願いいたします。
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そして次の役所に行って
窓口「それではマイナンバーカードのパスワードを入力してください！」
私「パスワードは4種類あるので、その命令では先に進めません。」
窓口「えっと、えっと・・・」
１つのオブジェクトに４つのパスワードを紐づける設計にGoサインを出した責任者は隠岐に遠島でよし。
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ほんと現在のCSの最適解は大学院からUSに「進学」。学部2年生くらいから準備すれば十分な時間。弊ラボからはUSに２名、UKに１名博士課程進学してます。
Metaでインターン始めて1週間ちょい過ぎたけど、環境がマジで良過ぎる
・ディズニーランドみたいなオフィス
・美味しくて無料のご飯
・バスでの送迎
・優秀すぎるチームメイト
・計算資源…え、多過ぎない？！
日本の大学生や高校生で興味ある人は、ちょっと米国大学院留学真剣に考えてみてもいいかも
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まずは「論文を読む」の深さを定義してくれないと。そうでないと「毎朝100報以上読む」人みたいになっちゃう。
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Can't agree more. 「留学」は昭和の概念。どの国で学ぼうがフラットに「進学」です。
ちなみにこの議論はMBAの話ではなく、どんな領域であれ知の世界でトップクラスの人々が集まり学び競う場に身を置くことのススメです。それが日本なら日本でいいし、欧州でもアジアでもいい。大事なことは若くて才能のある若者は国境を超えてトップの場所で自らの可能性に挑戦すべきと言うこと。
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10月1日より理研・医科学イノベーションハブ推進プログラム・健康医療データAI解析標準化ユニットのPIに着任します。臨床データに対する機械学習、特に深層学習の適用方法を研究します。この全く新しい分野を一緒に切り拓いてくれる研究員を募集します。勤務地：東京・日本橋
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ホモ・サピエンスにとって最も共通/普遍的なLatent space（潜在空間）は言語空間だった、ということが発見？確定？したのが西暦2022~2023年という理解かな。
意識は言語基盤の中間層みたいなもんで、それ自体は意味がなくて、その基盤の上で動いてる言語的な推論システムに意味があるんだってことだよね。クオリアとかどうでもいいんだよ。
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最後の相澤発言には心底驚いた。「科学的にするべきではない」のはコピペで博士号出したり、組織としての欲望でルールをねじ曲げてポストを与えたり、データも見ずに責任著者に名前を連ねることだ。
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