Sugi Lab
@sugitakulab
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Behavioral Systems Biology Lab in Hiroshima University, Graduate School of Integrated Sciences for Life.
Joined April 2022
シロアリの逃避行動です。開放的な環境に晒された途端一斉に逃げ急ぐ姿が見えますが、ハイライトは34秒くらいからで、大人が逃げ遅れた子供を助けに行く様子が見えます。当研究室ではこのような社会性行動の脳神経活動の動作原理を独自開発している4Dイメージング技術で解明する研究を行なっています。
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学術変革B「マルチスケール４D生物学の創成」が採択内定になりました。領域代表は名大の片岡直也先生で、当研究室は計画班代表として参画します。ライトフィールド技術を軸に様々な時空間スケールの4Dイメージング技術を開発し、中枢性老化寿命制御メカニズムの解明に応用します。.
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今村くん@bio_pypy が、第60回 日本生物物理学会年会で学生発表賞を受賞しました。多くの博士後期学生のなか、修士１年で受賞という、もの凄い快挙です。普段からのスーパーハードワークの賜物。これで昨年の前岡さんの量子生命フォーラムの受賞に続き、研究室から２年連続の発表賞受賞です。.
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Our C. elegans collective jumping paper is out in @CurrentBiology. We report the discovery that C. elegans leaps across an electric field to achieve phoretic attachment to insects.
Microscopic worms use electric fields to “jump” onto naturally charged bumblebee chauffeurs. @sugitakulab, @HokkaidoUni Katsuhiko Sato. Read more in @currentbiology:
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学術変革B「マルッと生物学」の活動の一環として、九州大学の伊藤研も誘い、書籍「システム生物学入門」の輪読会を開始しました。第１回は力学系のプロ、伊藤さん担当。
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当ラボの提案がJSTのSTART（ビジネスモデル検証支援）に採択されました。３次元空間をシングルショットで高分解能撮影可能なライトフィールド顕微鏡の事業化の可能性を検証します。.
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ついに輪読会で「細胞の物理生物学」を読破しました。１、２日の復習日（実験禁止）を設け、修論・卒論後からは、前期に輪読した「ディジタル画像処理」の知識をベースに「Bioimage Data Analysis Workflows」を輪読会する予定です。.
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新たに部屋を借り、暗室を作りました。室内には、6台の高性能計算機による並列解析を可能にする「リフォーカスステーション」も作りました。専任のテクニカルスタッフも来週から着任予定で、これまで出張実験で撮影したもののスタックしていた２Dのライトフィールド画像の解析が一気に進むことが期待。
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空間位相変調器SLM稼働。バイオロジーのラボでSLM使うラボは世界広しといえどほとんどないはず…。左はアインシュタイン、右は某社ロゴ。
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井上くん（学振PD）と今村くん（M2）が中心になって開発したライトフィールド技術について、新たに特許出願しました！これでライトフィールド技術についての特許は6件となりました。.
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ラボの日常11。メリークリスマス！🎄今年も多くの成果を挙げてくれました。Current biology含む原著論文2報→サイエンスZERO出演、学振DC1採択、学生の学会賞2件と学内エクセレントスカラーシップ受賞、国内特許出願4件と国際特許出願1件(JST PCT出願支援に採択)、挑戦的研究(開拓)、学術変革B採択。
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卒業生の前岡さんと学部４年の中根さんがQSTと進めていたライトフィールド技術 X 量子センサーの研究に関して、２件の特許を同日出願しました！これでラボ設立以来3年半弱でライトフィールド技術関係の出願特許は計5件になりました。.
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輪読会第三弾「Bioimage Data Analysis Workflows」を完走しました！これで今年度は以下の３冊を読破しました。
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Our new gear. Ti2-E now arriving for computational quantum imaging in smart 4D microscopy!
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学振DC1、PD、RPDの募集が始まったようです。当研究室では一昨年、昨年とそれぞれ学振PDと学振DC1が採択されました。当研究室を受入研究室としてご応募することに興味がありましたら、お気軽にご連絡ください。.
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メンバーも増え、現在稼働中の３台の防振台では手狭になったため、４代目防振台を導入しました。この白銀のキャンバスを新たな光学系で彩り、新発見を生み出します。
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JST未来社会創造事業に、研究課題「生体内三次元動態のオペランド解析技術の開発」が採択されました。３年後のステージゲート突破、本格研究へ移行できるような研究への発展を目指します。.
【📢プレス】.#未来社会創造事業 （探索加速型）令和4年度新規探索研究課題26件を採択しました. 探索加速型では、ステージゲート評価を経て探索研究から本格研究へと段階的に研究開発を進めます。. 💡採択課題・総評はこちら. #JST #科学技術振興機構
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前岡さんがヒト培養細胞の実験系をラボに立ち上げました。これで線虫、今村くんが導入したシロアリ、ヒト培養細胞とモデル生物の実験系が３種類になりました。PIは15年ぶりの培養細胞との再会です。
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At the same time as our electricity-dependent worm jump paper published online, an authority in ecology of electricity reports ticks example! We can guess many other examples exist and open a new paradigm, 'electric phorectic behavior', which might answer Darwin's final question.
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今年度、輪読会第3段を始めました。次回第2回はラボが誇るスーパーテクニカルスタッフ広瀬さんによるPythonを用いた解析方法のレクチャーです。.
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31日夕方、金沢で開催される日本発生生物学会で、東北大・梅津さんオーガナイズのフリースタイルWSでUnderstanding the principle of collective behaviors and development of real-time high-resolution light-field imagingのタイトルで発表します。初の発生生物学会参加です。.
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明日から始まる応用物理学会春季学術講演会で、PDの井上くん（3/23 2C会場13時半開始のセッションで23p-12C-13）とM2の今村くん（3/25 12B会場13時半開始のセッションで25p-12B-7）がそれぞれ口頭発表します。.
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Prof. Shawn Xu presents a really cool Dispatch for our C. elegans electric jumping paper! Thank you, Shawn and @CurrentBiology!.
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明日21時より、Scienc-omeで「光線空間を１つかみに支配するライトフィールド技術開発と脳神経活動計測への応用」のタイトルでラボの紹介をします。.
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明日から、こちらの光塾に参加します。前岡さん(M2)と今村くん(M1)はライジングスターセッションで口頭発表をします。.
参加申込が12/23(金)まで延長されたそうです。. バイオイメージングワークショップ「光塾」.1/18(水)、19(木) @阪大吹田キャンパス. 岡田康志さんの基調講演と6件の招待講演. 2022年度協賛：.科研費･学術変革(A)「散乱透視学」.日本生物物理学会サブグループ制度.
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JST未来社会創造事業の中間報告会での発表に伴い、共同研究者の臼杵研究室（静岡大学）が広島に来て２泊３日合同ゼミを行いました。こちらは中間報告会後の意見交換会の様子。
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第32回日本バイオイメージング学会学術集会（11/3-11/5＠北大）で学部4年の中根有梨奈さんがグラフィックアブストラクト賞を受賞し、M2の今村くんがベストイメージング賞を受賞しました！後日、こちらに掲載予定です。.
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学振PDの井上くんが中心になって進めてくれた光伝送ファイバーを用いたコンピュテーショナルイメージング技術について、特許出願を行いました。これで広島大学着任後4年で、出願特許数はPCT出願を含め、8件になりました。.
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We also discovered that C. elegans can transfer and attach to the bumblebee to disperse over long distances using an electric field.
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（宣伝）当研究室ではシングルショットで3D空間を撮像できるライトフィールド技術という独自技術の開発とそれを用いた行動や老化機構の研究を行なっています。バイオロジーとフォトニクス・エンジニアという異なる分野の力を両方身につけたい学生の方はお気軽にご連絡ください（見学だけでもOKです）。.
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今村くん(M1)、前岡さん(M2)が令和４年度広島大学エクセレントスチューデントスカラーシップに選ばれました！全学で倍率30倍の狭き門を見事勝ち抜きました。.
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領域略称は「マルっと生物学」でマルチスケールとまるごとを掛けています（当研究室PI（関西人）の発案）。ロゴは代表の片岡先生の渾身の作品でこちらです。
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明後日から大阪大学で開催されるバイオイメージング学会で、M2の前岡さんが「高感度ライトフィールド３Ｄ量子センシング技術の開発」(P-67）を、M1の今村くん@bio_pypyが「ナノ分解能シングルショット３Dライトフィールド顕微鏡の開発」（P60, S4-5）をそれぞれ発表します。.
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今年度、輪読会の第二弾「細胞の物理生物学」がついに半分を折り返しました。かなり難易度の高い教科書ですが、学生主体で必死に進めています。.
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Our paper is highlighted in Science. Watch these worms jump with electricity | Science | AAAS
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We are now preparing the 3rd and 4th papers that follow Curr Biol 2023 paper and Nat Commun 2019 paper. Our lab also established 4D computational imaging technology that can be applied to our collective behavior and neural circuit aging research!.
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弊ラボでは今期前半は共同研究先のラボ（工学部）と合同でこちらの書籍の輪読会を進めています。いまの生命科学は画像解析技術必須＆弊ラボはコンピューテーショナルイメージングにどっぷり浸かってるので、研究と直結する内容も多く、かなり有意義な名著です。.
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Further surprisingly, a single worm that lifts up to 100 worms can also leap across an electric field, termed "collective multiworm transfer".
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お盆休み前最後の輪読会で、ヘクト光学Ｉ「幾何光学」を無事完走しました（全て録画）。次は配属された新人を迎え、ヘクト光学ＩＩ「波動光学」を輪読会予定です。.
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推薦入試Aの募集要項が公開されました。光工学と画像処理やAI等の情報科学が融合したコンピュテーショナルイメージングの技術開発とライフサイエンス分野の研究（脳神経回路動態など）に興味がある方はお気軽にお問い合わせください。.
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In this paper, we were curious about why a huge number of worms can move to a lid because a lid of a Petri dish contacts with a dish at only three locations. We noticed that worms took off from agar, leaped across a gap, and eventually appeared on the lid like "teleportation".
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博士前期入試の募集要項が公開されました。4Dコンピュテーショナルイメージング技術とバイオロジーに興味のある方はお気軽にご連絡ください。質の高いバイオロジカルクエッションを立て、それを解くための高い技術開発力・装置開発力を身につけることに目標を置いています。.
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We previously published a paper in which C. elegans collectively form a network pattern on the lid of a Petri dish (Sugi et al. Nature Commun, 2019).
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