:marimiya
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Protein Metrics(プロテインメトリックス)というバイオ医薬品の質量分析装置から出てくるデータの特性解析をするソフトウェアの開発・販売をする会社で働いています。ポジティ部。鳥と猫と写真好き。リツイートは必ずしも同意やおすすめを表すものではありません。🇨🇳🇮🇩🇰🇷勉強中
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タスマニアであった学会は、託児所スペースに学会発表をライブ中継してるテレビがあって、子供さんを膝に乗せながら発表を聞いてるお父さん・お母さん研究者が居て新鮮だったな。あれはいいアイデアだと思うな。
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これは秀逸。移動を制限することの効果がよく理解できる！
These simulations show how to flatten the coronavirus growth curve
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これ面白いな。同じデータ、同じ質問に29のチーム、61人のデータ解析者が加わって解析した結果のばらつきについての論文。
Published! "Many Analysts, One Dataset: Making transparent how variations in analytical choices affect results" 65 of us led by Raphael Silberzahn demonstrate the contingencies of analytic decisions on observed outcomes. (OA: )
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えー！サーモがキアゲン買っちゃうの！！とうとうこんな日が。。
Thermo Fisher Scientific to Acquire QIAGEN N.V.
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そうそう、結婚していなくて、まだ実印を作っていない女子の皆様へ 実印は下の名前で作っておけば、結婚しても実印の変更しなくて楽ですよ。万が一の離婚にも安心。今日会った人は、成人の際にご両親から下の名前で実印をお祝いにもらったとか。すごいナイスなアイデアと思いましたね。
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ナノポアで植物のDNA抽出がうまく行かない人はこれを見て！MinIONで23.7Gb出した人のプレゼン。神すぎ。
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今日でナノポア勤続2年目。1年目は、あっという間に過ぎた。今は、まだ2年か、という感じ。2年前は日本で一人だったけど、今チームは6人になり、お客さんは10倍になった。3年目の記念日に会社がどうなっているか想像も出来ないけど、想像できないような未来を作っていくぞ！
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酵母のゲノム、16染色体全部合成して作ったとかマジですか！ スゴイ。
Scientists have successfully synthesised all 16 chromosomes of a yeast organism, achieving a world first with repercussions for health and sustainability. The breakthrough will be announced today at a conference hosted by Macquarie.
#LighthouseNewsflash
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NASAで働くためには何を大切にすればいいですか？という、ちびっ子への答えが「今、自分の目の前にある、やるべき事に集中」とな。皆さん聞こえましたか。
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初日終了！今日からProtein Metrics社で日本と韓国のカントリーマネージャーとして勤務を始めました。これからはタンパク質の解析ソフトに携わりながら、バイオ医薬品やProteomics, タンパク質や翻訳後修飾などの分野に携わります。学ぶ事がとても多いですが、楽しみです😊
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本日付で株式会社オックスフォード•ナノポアテクノロジーズ日本法人のジェネラルマネージャーに就任いたしました。これからは日本をベースにより多くの人達がナノポアシークエンスをスムーズに利用し更なるアイデアを産み出していただけるよう尽力してまいります。引き続きよろしくお願いします。
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この度、アソシエイトダイレクター職を拝命いたしました。ますますナノポアシークエンスを広めていけるよう精進いたします。引き続き、ご指導ご鞭撻のほどよろしくお願い申し上げます。
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いろんな人の履歴書や職務経歴書を拝見していて思うのは、WordじゃなくてPDFで送った方がいいと思うこと、ページが複数になる場合は、ページ数を入れた方がいい事、ファイル名に自分の名前を入れた方がいい事。もちろん全て出来てる人もいるし、細かいかもしれないけど、印象は違う。
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今日、メグちゃんの病院から連絡があり、酸素チューブ無しでも血中酸素濃度を維持できるようになり、木曜日に退院が決まりました😭😭😭引っ越しで連絡が遅くなりましたが、TLの皆様にはご心配おかけしました。誰かに報告という形でアウトプットしないと後悔と不安だけが積もって押しつぶされそうでした
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本日付でアジアパシフィック地区のビジネスマナージャーに就任いたしました。これまでは日本・オーストラリア・NZ・シンガポールと4か国の担当でしたが、さらに東南アジアを担当します。シンガポールのメンバーをチームに加えて、チームもさらに大きくなりますが引き続き精進してまいります。
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この間の鶴岡の学会でお話した内容から解析ワークフローの部分を抜粋してブログにしました。ご参考になれば幸いです。コメントなどありましたら、そっとお教えくださいね。
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絶滅危惧種のゲノミクスを研究する研究者をサポートするプロジェクトを立ち上げました。関係される皆様、是非ご一読ください。個人的にもとても嬉しいアナウンスです。
Introducing : a pilot-stage project designed to support faster, more localised DNA sequencing of
#criticallyendangered
species, using the latest ultra-long read approaches from
@nanopore
. Read more:
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TLの皆さま
先週の19日午後にメグちゃんが天国へ行ってしまいました。気持ちの整理が着いてから、人に話をしようと思っていましたが少し時間がかかりました。私はオーストラリアで最期を看取る事も、もう一度抱きしめてあげる事も出来ませんでしたが、Skype越しにみた顔はとても安らかでした。
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明日から休暇なので気になっていた「10年後の仕事図鑑」を買ってみた。ホリエモンと落合陽一さんの本。ちょっと読み始めたけど、やっぱり面白い。イーロン・マスクの未来を創る男と平行して読もう。
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私も書きましたよ☺️
実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ：ロングリードWET&DRY解析ガイド シークエンスをもっと自由に！〜リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術 - 羊土社
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ロングリード用のマッピングツール、NGMLRと構造変異検出ツールSnifflesの内容をブログにまとめました。 誰かの役に立てば幸いです。
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ナノポアシークエンサーのAppが出たよ。シークエンスの実行や離れた場所からでもAppでシークエンサーの状況をチェック！是非インストールしてみてね。
Introducing the new MinKNOW App — now available to download on iOS and Android devices!
Use the App to start your run, monitor progress in real time and manage your device, remotely. Find out more:
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ナノポアを火星で実行するための検討論文。地球外生物は居るのか。。やっぱり火星でシークエンスするための評価って全然違う視点だな。論文面白い。
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本日より少し昇進しましてAPACと日本地区のコマーシャルシニアダイレクターとなりました。ここ半年ほど、まさに身を粉にして働いていましたが、東南アジアの国々に代理店ネットワークを築き購入が難しかった国へも製品提供ができるようになりました。引き続き頑張ります！
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今日ブースに来てくれた何人かの人に言おうと思って名前が出てこなかったロングリード用のDe novo アセンブリはこれ。wtdbg2. miniasm 並みのスピードでcanuと比較できる精度を出すという事。是非お試しください。
wtdbg2/README.md at master · ruanjue/wtdbg2 · GitHub
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良い子のみんなは、日曜日の夜はNHKのサイエンスZeroでナノポアをチェックだよ。姐さんとの約束よ。
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このツイート、リツイートが100件超えた！ 企業の皆さん、託児所や、そこへのライブ中継費用を学会スポンサー費用に追加(明記)して、会社のロゴやカタログを託児所に設置させてもらえれば、企業イメージアップにつながるのでは！
タスマニアであった学会は、託児所スペースに学会発表をライブ中継してるテレビがあって、子供さんを膝に乗せながら発表を聞いてるお父さん・お母さん研究者が居て新鮮だったな。あれはいいアイデアだと思うな。
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日本でGPUとCUDAのトレーニングやります！NVIDIAさんとの共同開催です。より効率的にGPUを使いたい人、ぜひ！
Beginner向け10月23日午前
Advanced User向け10月23日午後・24日
本社からスーパー詳しい人が来日するので、ぜひお申し込みください！
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このたび弊社では、taiyaki たい焼きをリリースしました。taiyaki (たい焼き) では、guppy (グッピー) ベースコーラーを元にベースコールをトレーニングする事が可能です。是非独自のたい焼きを作成ください。
GitHub - nanoporetech/taiyaki: Training models for basecalling Oxford Nanopore reads
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Avicii 自殺だったの。。。Avicii's family: He couldn't go on any longer - BBC News
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ミナイオン工場です！ホントにミナイオンの形w
Meanwhile, we continue to invest in innovation to can drive continuous improvement of our technology. We're investing in commercial and operational expansion so that we can support more customers around the world. Thanks to the
@nanopore
community for your ongoing support. [3/3]
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gggenes か。ggplot2の進化すごいな
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マイクロアレイからNGSへ移って勉強したこと無駄になったなって思うことも多かったけど、統計検定の基礎は役立った。ショートリードからロングリードに移って使うツールも変わってまた勉強やり直しかと思ったけど、アライメントスコアとかの基礎は理解を早める役に立った。深掘りするのも大事。
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ナノポアのDirect RNAシークエンス使ってモデルナのワクチンのPoly-Aテールが体内でどう処理されているか調べた論文。再アデニル化で伸びてるとか驚き。安定化にポリAが寄与してるのは聞いていたけど、しかも再アデニル化が起こるプロセスも調べられていて、いろいろ驚き。
It's my pleasure to share with you are latest preprint demonstrating that
#COVID
-19
#mRNA
#vaccine
is re-adenylated in vivo.
@IIMCB_Warsaw
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Word に含まれた大量の表をExcelにしてほしいという依頼があったけど、.html で保存してExcelで開くと全部抜き出せているという技を発見。
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はー、無事に契約終了。土地買った。後は建築家の人を決めてお家を建てる。自分名義で住宅ローン組んで土地付き戸建を注文建築。ここまでよく頑張ったよ、お疲れさま自分。
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ナノポアで1,817人のアイスランド人ゲノム解析した結果がdeCODEの人達よりプレプリントで報告されました。待ってました！！
Long read sequencing of 1,817 Icelanders provides insight into the role of structural variants in human disease
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@b09a2032c
これまでたくさんの写真や動画をありがとうございました。お別れの時が近づいているとの事、そんな状況の中でもサンの仔猫時代を共有くださりありがとうございます。かもしかさんの元でユキと一緒に暮らすことができてサンちゃんはとても幸せだと思います。これからも見守らせていただきます。
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そうそう、オーストラリアの学会でいいなぁと思ったのは、学会会場に託児所があるだけじゃなくて、そこにテレビがセットされてて、メインの会場のスライドや講演が聞けるってとこ。写真を撮り忘れたけど、お子さんと一緒に聞いているお父さんやお母さんが居て、なかなかいい仕組みだなと思った。
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今更ながらにマイクロソフトのPresentation Translation アドイン入れて、英語のスライドを一発で日本語変換してみて、その簡単さに驚愕。もちろんめちゃくちゃな訳もあるけど、まぁそれは単語で一括変換すればいい訳で。例えば、弊社の場合、ポアが毛穴って訳されてるとかｗ
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メグちゃんの面会だん！ すごく元気になってました！ 20分くらい面会できたので、いっぱい顔を猫ちゃんマッサージしてあげました。先生がカルカンの袋を開けると鋭く反応して、ご飯も食べていました。後は鼻の酸素の管を抜いて合併症などがでなければ、来週退院出来るかも！と。頑張ってメグちゃん！！
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今年もナノポア現場の会を開催します！今年は8月21日、22日の2日間。どちらか1日のみの参加も可能です。参加費は無料。この機会を是非お見逃しなく！
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いつも私達と一緒に寝ていたベットで眠ったまま天国へ行ってしまったようです。何とか退院出来たと思ったのですが、家に帰るまで頑張ったのかなと思います。悲しみと後悔と寂しさと罪悪感が入り混じった気持ちですが、皆さまにもご心配をおかけしました。何とか仕事は終えて明日帰国します。
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今日から仕事初め。今年からシンガポールも新たに担当になり、4カ国のビジネスを管理する事になりました。これまでの経験を活かしつつ新たなお客様からの学びでよりナノポア製品をうまく活用してもらえるよう2019年も頑張り���す！
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電話代払うから、NGSのご経験をとある外資企業に語ってコンサルしてあげてください、ってすごいメール。私は良い給料くれる会社で働いてるし、何で電話代ぐらいでコンサルしないといけないのか分かりません、もう少しアプローチの仕方考えてはと一刀両断。
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ご心配をおかけしましたが、皆様の優しさや温かい言葉にとても励まされました。とても色々な事を考える3ヶ月と少しの無職期間でしたが、これまでと分野が違っても、是非気軽にお声がけください。引き続きどうぞよろしくお願い致します。
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だまっててもいい機会って巡ってこないから、「自分でやります」アピールがとても大事。これはこっそりとかチラッというとか、常にあちこちチャンスがあれば、「私それやります」って言わないと、だいたい面白い仕事は誰かに持って行かれる。
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ようやく新しい家族を迎える心の準備ができてきました。今度は困っている猫ちゃんをお迎えしようと思っています。高尾近辺で猫のシェルター、または里親募集がありましたら、お教えください。良いご縁をお待ちしています。
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「あの、名前ってなんでしたっけ、ミ、ミ、ミ」
私 「ミヤモトです！」
「え、シークエンサーの名前。。。」
私 (恥) <- イマココ
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今日聞いた話は印象的だったな。亡くなった人のゲノムを調べて原因となった可能性のある変異を同定し、家族に説明して家族に同様の変異がないか調べる。死から生への還元という言い方も印象的だった。
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コロナが再感染するか、おサルさんでテストしてる論文がでてたのね。再感染は確認されなかったようで安心。もうここまで行われて論文になってることは驚きのスピードだな。
Reinfection could not occur in SARS-CoV-2 infected rhesus macaques
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博士号取得者のみんなは3年の実務経験ありとみなされるらしいよ！
「博士号取得者は3年の実務経験とみなします。」(募集要項より)
#JAXA
#宇宙飛行士募集 サイトがopenに👩🚀 応募条件からは理系及び大卒の縛りがとれ(実務経験3年は必要)、選抜試験の中でSTEMの素養を見ていく形になっています。 身長も149.5-190.5cmと幅が広がっています。＃宇宙飛行士に転職だ
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今日のプレゼン、ボスから「あなたのユーモアのセンスは素晴らしい！」と褒められて関西人としてスーパー嬉しい。3回は爆笑を得ました！
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良い子のみんな、分生でワイワイやってる間に、またナノポアのベースコーラー、Guppyがアップデートされたよ。今度はVBZ圧縮でFast5を40％に圧縮！バーコードの分類性能があがり、さらにDual Barcodeのプロトコルも公開されて2306種類の組み合わせが可能だよ。コミュニティサイトをチェキラ☆彡
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学会でブース展示の費用に追加して、託児所設置に使ってもらったり、託児所に中継用テレビを置くために使ってください、とかするのもいいのかも。託児所設置で参加者数増えれば企業もハッピーだしね。聞いてみよ。
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顔が似てる人のオミクス調べた論文。メチル化はあまり関係してないけどSNPは関係がありそうと。
Have you ever wondered if you have a double? Thrilled to announce our
@CellReports
@CellCellPress
article describing the multiomics study of look-alike humans!
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