Kawano Lab. (東京農工大学 川野研究室)
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OFFICIAL / nanopore, DNA computing, transmembrane peptide, molecular robotics, de novo design, microfluidics, electrochemistry
Koganei, Tokyo
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2024年4月から農工大では学振PDは特任助教として雇用され、給与up（~45万/月）、手当・社会保障等完備です！！
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Thrilled to share our first Nature Nano article about de novo designed nanopore that incorporates a β-hairpin peptide.
Great work done by Shimizu-kun and prominent collaborators in Kawamura lab and Usui lab!
This is OPEN access!! (1/n)
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藤田さん（M1）の研究成果が日程電子版に掲載されました！
ペプチド1分子、ナノサイズの穴で検出 東京農工大など: 日本経済新聞
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Fujita-san's (M2) first first-author paper on cell-free nanopore is now open in ACS Nano!
Congratulations!
Cell-Free Expression of De Novo Designed Peptides That Form β-Barrel Nanopores
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M2の鈴木さんが細胞を創る研究会でポスターセレクションに選出され口頭発表しました！昨日まで超越分子の領域会議に出席しており、時間がない中準備して良い発表ができました！お疲れ様でした！！
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We are happy to share our new paper today
@JACS_Au
on microRNA pattern recognition based on DNA computing technology and nanopore sensing. Congrats,
@ntake3110
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川野研究室は今年で10周年を迎えました！それをお祝いする会を催し、たくさんの卒業生が集まってくれました！皆様、ありがとうございます！引き続き頑張っていきます！！
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2022年測定納めの今日、ポアが開きました！！👏
更新者はとても良い気持ちで新年を迎えられそうです。よいお年を。🐯→🐰
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今年度から学振PDだった岩渕さんと本研究室で学位を取られた竹内さん
@ntake3110
が特任助教として着任しました。すでに特任助教として在籍しているホウさんと3人体制で研究室を運営していきます！引き続き、よろしくお願いいたします！
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ピペットマンを分解して掃除しました😀
Today, we took the pipettes disassembled and cleaned them.
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Our latest work is out! "Simultaneous Recognition of Over- and Under-Expressed MicroRNAs Using Nanopore Decoding" - inspired by the DNA computing methodology. Congrats, Takiguchi-kun!
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先週ドイツで行われたBFNMにて、D3竹内さん、D2滝口くん、D2山地さん、M2藤田さんが発表を行いました！
D2滝口くんがポスター賞を受賞しました！おめでとうございます🙌
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名古屋で行われた生物物理学会でD2山地さん、M2の橋本さん、藤田さん、M1の小川さん、神原さん、B4の江村くん、佐藤さん、中田さん、羽切さんが発表を行いました！
B4佐藤さんが口頭発表にて学生発表賞を受賞しました！おめでとうございます🎉
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Our review article on molecular robots is now open at Lab on a Chip! It has been selected as Lab on a Chip HOT Articles 2023!
Thanks for co-authoring with us
@DiMicheleLAB1
@YuvalElani
@tomo_matsuuraG
"Lipid vesicle-based molecular robots"
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生物物理＠函館にて川野研から2名の学生が公演賞をいただきました！！
劉娉さん（D3）のナノポアによるメチル化位置の検出
宮城さん（M2）のマラリアトランスロコンナノポアによる一分子ポリアミノ酸検出
です。おめでとうございます！！
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Takiguchi’s 1st paper in my lab is published in Nanoscale and introduced in the TUAT press release!
滝口くん(M1)の初の筆頭著者論文がNanoscaleに掲載され、本学のプレスリリースで紹介されました🎉
論文
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川野研究室にて特任助教の先生を募集いたします！
募集分野は、ペプチド化学、MDシミュレーション、進化工学、De novoデザイン、です。よろしくお願いします！
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Gas vesicle !! 細菌の浮力を制御しているらしい。タンパク質の殻が気体を閉じ込める。おもしろそう！
Gas vesicles are gas-filled but gas-permeable protein shells that make cells float. Here is the peer-reviewed (published published?) version of our preprint determining their molecular structure and assembly:
#cryoEM
#gasvesicles
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New
@ChemRxiv
preprint on microRNA pattern recognition using DNA computing and nanopore decoding! We successfully distinguished microRNA expression patterns in clinical plasma samples of bile duct cancer patients and healthy volunteers.
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I, Ryuji Kawano, got promoted to a full professor
@TUAT_all
today! I highly appreciate all lab members, collaborators, colleagues, friends, and my family for their supports.
本日付で川野が教授に昇任いたしました！
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We really enjoy both science and wines at the IRP& iCeMS joint seminar 2023!
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Thank you for tweeting our research and picking it for the supplemental cover!
Pattern Recognition of microRNA Expression in Body Fluids Using Nanopore Decoding at Subfemtomolar Concentrations
Nanami Takeuchi, Moe Hiratani, and Ryuji Kawano
@TUAT_EN
#openaccess
#cancerresearch
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竹内さんの博士公聴会が開催されました！お疲れ様でした！
Congratulations to Takeuchi-san
@ntake3110
on her Excellent PhD defense!
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Thanks for visiting our lab, Lorenzo form Cambridge, James from ICL! We really enjoyed discussing science and eating okonomiyaki!!
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京都大の古川修平先生によるセミナーがありました。様々なお話を伺うことができ、とても勉強になりました！ありがとうございます🙌
その後、満開の桜を前にお花見を行いました🌸
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【拡散希望】川野研究室で特任助教の先生を2名募集しています！
来春学位取得者歓迎です！詳細は下記をご覧下さい。
お知り合いで該当する方がいれば、お知らせいただけると助かります！！
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We have succeeded in electrophysiologically observing the oligomerization process of amyloid β monomers to form oligomer channels on the phospholipid membranes! These results have been published in
@PNASNexus
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滝口君の博士公聴会が無事終わりました！お疲れさまでした！
Congratulations to Takiguchi-kun for a stellar PhD defense!
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多田さん、竹内さんの生体ナノポアを利用したDNA分子のカウント・抽出に関する研究成果がAAASのEurekAlert!に掲載されました!
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Collaborative paper on small protein capture by nanopore with Mauro and Fabio is now open in ACS Nano! Yamaji-san did great work.
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DNAがナノポアを通過しています！
DNA molecules are passing through the nanopore.
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Very interesting!
"These results collectively suggest that bilayers containing DOPC and POPC bilayers with biological head group chirality are enantioselectively permeable to amino acid derivatives with biological chirality."
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名大と九大の共同研究者の皆さんと一緒にマイクロデバイスを利用した電気生理計測を行いました！楽しい！！
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I am happy to share this preprint on de novo peptide nanopore with α-helical barrel!
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駅伝大会前の最後のランニング練習をしました！
川野先生からのご指導のおかげで、持久力•精神ともに成長しました🔥
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和泉さんの研究成果が本学からプレスリリースされました！
#農工大 の川野竜司教授らは、人工細胞の変形を膜に結合するペプチドの二次構造によって誘起し、人工細胞を形状制御できる可能性を示唆しました。本技術は、目的に合わせて異なる形状に変形するリポソーム型分子ロボットへの応用が期待されます。
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M2藤田さんと川野先生で執筆した総説「無細胞合成系によるde novo ペプチドナノポアの迅速合成」が化学工学 - 電子版 - の特集：ペプチド科学の最近の進展に掲載されました！
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Prof. Aleksei Aksimentiev
@aksimentievLab
and Takuya Mabuchi
@MabuchiGroup
visited and gave excellent talks on MD simulations in our lab. Their presentations were impressive and stimulating.
We also had a great time enjoying a Tempura Soba lunch together!
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We are ready to attend BPS2023
@BiophysicalSoc
!
(simulation of poster presentation in English!!)
サンディエゴで開催されるBPSに向けてポスター発表練習を行いました！この部屋の中はサンディエゴです！
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M1の鈴木さんが昨年12月の第5回ナノバイオ交流会で「最優秀講演賞」を受賞し、農工大のニュースに掲載されました🌸おめでとうございます！
講演タイトル「リポソームへの分子輸送による診断治療システムの構築」
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Brian Ng from
@bayley_lab
and
@DiMicheleLAB1
visited our lab and gave an interesting talk today! Thanks a lot, Brian!
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卒業生の多田さん・D3竹内さんの論文が本学からプレスリリースされました🎉
#農工大 の川野竜司らは、ナノポアを用いて1～100分子レベルの標的DNA分子を1分子ごとにカウント・抽出することに成功しました。本技術は、疾患診断や医薬品開発などの分野におけるDNA分析への応用に期待されます。
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ナノポア形成ペプチドSVG28の結果に関する総説が生物物理学会誌に掲載されました👏
清水くん(卒業生)、宇佐美くん(卒業生)、M2溝口くん、M1藤田さん、川野先生が執筆しました！
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明日から開催のBPS2023（）でD3劉さん、D2和泉さん、竹内さん、D1山地さん、M2林くん、福田さん、溝口くん、宮城さん、Zhengくん、M1藤田さんがポスター発表を行います！また山地さんがSubgroup Symposium: The Nanoscale Approaches to Biologyにて口頭発表を行います！
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学変A「超越分子システム」のキックオフシンポジウム・公募説明会が12月4日オンライン開催されます！
詳細と参加申し込みは下記からお願いします。
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ホウ先生が地元の朝ごはん、南昌米粉を作ってくれました！毎日研究して完全再現してくれました！また食べたいです😋
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M1の藤田さんが、配属された3年生向けにMDシミュレーション講座を行ってくれました！大変理解しやすい授業でした👏
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顕微鏡の暗室が完成しました👏B4の鈴木さんが中心となって、設計・発注・組立までみんなで協力して作りました👨👩👧👧
by 川野研DIY部
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11/4-5の「細胞を創る」研究会14.0にて、D1の和泉さん、B4の橋本さん・鈴木さんがポスター発表を行います！
和泉さん「ペプチドによるリポソームの変形」
橋本さん「細菌膜オンアチップ:マイクロデバイスグラム陰性細菌膜の再構成」
鈴木さん「分子ロボット開発:リポソーム内DNAコンピューティング」
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2020年卒の高井さんのカーボン膜に固体ナノポアを作る論文がMicromachinesに掲載されました！川野研究室ではすべての学生の成果を論文にすることを目標にしています！2020年卒はあと1人！
Simple Fabrication of Solid-State Nanopores on a Carbon Film #
#mdpimicromachines
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Our paper on “Pattern Recognition of microRNA Expression in Body Fluids Using Nanopore Decoding at Subfemtomolar Concentrations” has been featured on the Supplementary Cover of
@JACS_Au
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@ACS4Authors
#MyACSCover
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竹内さんと平谷さんの論文がACS Insights日本語版で注目のオープンアクセス論文に選ばれました！
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Cell-free riboswitches - now published in RSC Chemical Biology
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後片付けも一段落したのでCheminas49の開催報告です。先週末、無事本学で第49回大会を開催し、土日にもかかわらず200名以上の方に参加いただけました。
RSC
@RSC_Japan
からAnalyst賞、Lab on a Chip賞の各賞をサポートいただきました！皆様ありがとうございました！
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Fujita-san's (M1) recent study on de novo nanopore has been selected as the supplemental cover picture for the latest issue of ACS Nano. Congratulations to Fujita-san on this well-deserved recognition!
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During Mauro-san's final day with us at the lab, he prepared a delightful Italian pasta, we called as "Mauro Special". We thoroughly enjoyed the pasta and wines, making for a memorable evening.
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4/1に東北大学から岩渕祥璽さんが学振PDに着任されました！
これからよろしくお願いいたします！
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Izumi-san's (D2) first first-author paper on liposome deformation is now open in Micromachines!
Many congratulations!
Liposome Deformation Induced by Membrane-Binding Peptides
#mdpimicromachines
@micromach_mdpi
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本日から開催される「細胞を創る」研究会15.0で川野先生が招待講演、B4の神原さんがポスター発表を行います！
川野先生: O-1「人工細胞膜システムを創る」
神原さん: P-1「意識を持つ分子システムの創製に向けて」
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本日、分子サイバネティクスと超越分子システムの合同シンポジウムに参加しています🙌
M1の鈴木さんが以下のタイトルでポスター発表します！
「リポソーム型分子ロボットの開発: DNA演算による腫瘍マーカー検出」
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第59回日本生物物理学会年会にて、M2の滝口くんが学生発表賞を受賞しました！！おめでとうございます🎉
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本日、学科のソフトボール大会とモルック大会が同時開催です！！川野研は朝練しています🔥
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amyloidβのモノマーがリン脂質膜存在下でオリゴマー化しチャネルを形成する過程を電気生理学的に観測することに成功しました！またオリゴマー阻害剤の阻害アッセイにも成功しています。この成果がPNAS Nexusに掲載され、本学からプレスリリースされました！
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本学からプレスリリースされました！
〔2021年11月24日リリース〕ナノポアを形成する新規ベータシートペプチドを設計しDNAおよびタンパク質1分子を検出することに成功
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第58回日本生物物理学会年会（BSJ2020）において、学部4年の宮城さんが学生発表賞を受賞しました。おめでとうございます！！
＃BSJ2020
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Today published in Analytical Chemistry, and selected as the Supplementary Cover!
Please check this out.🧬
Our latest work is out! "Simultaneous Recognition of Over- and Under-Expressed MicroRNAs Using Nanopore Decoding" - inspired by the DNA computing methodology. Congrats, Takiguchi-kun!
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本日、日本生物物理学会サブグループ「人工細胞モデル＆分子ロボティクス」のキックオフミーティングにて、川野先生が講演を行います💁🏻♂️
タイトル「リポソーム型分子ロボットの開発」
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M2藤田さんがポスター発表部門でオーディエンス賞を受賞しました！！おめでとうございます🙌
また今回のサイボウニクス研究会をオーガナイズしてくださった東大桐谷研の皆さま、ありがとうございました！とても楽しかったです！
明日開催の第9回サイボウニクス研究会@東大駒場キャンパスにて、B4全員が口頭発表、修士・博士学生がポスター発表を行います。
今年は様々な企業からご協賛いただいています、ありがとうございます！
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学変A 超越分子システム領域のキックオフシンポジウムがもうすぐはじまります！久しぶりのオンサイト@東工大！
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市橋さん！本日の朝日の書評欄を見ていたら大きく紹介されててびっくりしました！買います！
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D1滝口くん、川野先生が分担執筆した書籍 "MicroRNA Detection and Target Identification (Methods in Molecular Biology book series）" がSpringer社から出版されました！核酸等温増幅とナノポア計測を利用した低濃度microRNA検出に関するプロトコルです。
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Our recently published papers in Anal. Chem. are now open access! Please check them out.🧬
Thank you for the kind support from the WISE program, TUAT!
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