最近気づいたこと。 医師がカルテで検査オーダー 結果を受け取り解釈する 私たちがAIでなにか依頼する 結果を受け取り解釈する 一緒。 たまに間違うよね。 結果に対して問い合わせして、より専門家的な意見聞ける 専門すぎてたまに理解できないよね。 あとはどれだけ検査室をAI化できるかか？

Nanoporeのシークエンス解析のEPI2MEが変更されて使いにくくなってしまったので急遽作りました。 もっと良さげなUIのが欲しい。

Amazonで青色LEDライト売ってたので使ってみました。

使用する試薬が段々と変わって行きました。 LongAmp PCR Extension 1Kbp/50sec Premiam II Hot Start PCR Extension 1Kbp/15sec KOD One PCR Extenshion 1Kbp/1〜10sec PCRやってる時間が待てなくなってきたので。 KODはdAテールが付かず、平滑末端です。 ポリメラーゼの種類に気をつけて。

なんとかめんどくさいPOT法の作業を簡単にしたい‼️ POTはいいけど手間がかかり過ぎる。 こんな感じでAIでバンド認識してもらって、POT値はデータベースで管理はどうでしょうか？ どうしてます❓POT値データの管理。

寒天クックの調整が難しい。 しかし、ちゃんと泳動出来る！ もうちょっと硬め？

普通にアガロースゲルでPOTを電気泳動しました。 意外とアガロースは購入コストがかかります。 なので寒天クックの出番です！ スーパーで激安で売ってます！

おねだりすると買ってくれました。

PCR終わったら電気泳動してバンド見たいけど。 電圧かけるだけじゃない？ いけるいける。 泳動槽3Dプリントして、電極は余ったネジ。ステンレス線付けて完成。 100vからブリッジダイオードで直流にして分圧。 よさげ。 一度、電極ショートさせて検査室のブレーカー落としました。 すみません。

結局DNA抽出やらPOTやらでサーマルサイクラーが渋滞するので追加で自分で購入したり、おねだりして増えました。

✨ PCRに必要なサーマルサイクラーが手元にない！ 自作しました🛠️ オープンソースハードウェア（OSH）を活用して、低コストでサーマルサイクラーを作成！

あらら。結局1日かかったじゃん。エラーじゃないエラー出ると解決できないじゃん。

x4でしたね。

PCRやろう！ と思った���まず試薬の準備からと思いますが、やり始めた当時は安い試薬を散々探しました。 1番はバイオアカデミアさんでしょうか。HP見ると3920円でした。 個人輸入もしてみました。輸送料で5000円でした。 DONGSHENG BIOTEC社？ 個人開発では安さは本当に助かります。

SOPの悪夢から抜け出したい。 まだ機能が足りんぞ。

ただの砂だがいい仕事してます。 砂beatingと製品のジルコニアビーズでDNA抽出を比べます。 NC=陰性コントロール SB=砂beating ZB=ジルコニアビーズ BeatingしてそのままPCRをかけました。違いはなさそうです。 DNA半定量でも SB 11μg/ml ZB 3μg/ml とSBの方が多くDNAを抽出出来ているようです。

いや。イラっとするな。o1でもこの回答だと。初めから自分で書けばよかった。

おっ。ナイス

昔カンジダのDNAが抽出出来なくて、夜中の3時くらいまで粘った辛い記憶があります。 物品が揃っていなかった当時は熱アルカリ抽出法くらいしか出来なかったので当然です。 今は最強のメソッドである砂beatingが使いこなせます！しかもホムセンで大量に取得できます。 茶こしでサイズを選別します。